Σημειώνονται:

ελληνικά σύντμηση σύμβολο αγγλικά σχόλια
αλανίνη Ala A alanine (en)
αργινίνη Arg R arginine (en) *
ασπαραγίνη Asn N asparagine (en)
ασπαραγινικό οξύ Asp D aspartic acid (en)
βαλίνη Val V valine (en) !
γλουταμινικό οξύ Glu E glutamic acid (en)
γλουταμίνη Gln Q glutamine (en)
γλυκίνη Gly G glycine (en)
θρεονίνη Thr T threonine (en) !
ισολευκίνη Ile I isoleucine (en) !
ιστιδίνη His H histidine (en)
κυστεΐνη Cys C cysteine (en) *
λευκίνη Leu L leucine (en) !
λυσίνη Lys K lysine (en) !
μεθειονίνη Met M methionine (en) !
προλίνη Pro P proline (en)
πυρρολυσίνη Pyl O pyrrolysine (en) =
σεληνοκυστεΐνη Sec, Se-Cys U selenocysteine (en) =
σερίνη Ser S serine (en)
τρυπτοφάνη Trp W tryptophan (en) !
τυροσίνη Tyr Y tyrosine (en) *
φαινυλαλανίνη Phe F phenylalanine (en) !
ωάγνωστα Xaa X zunknown ?01?
ωβλ. ασπαραγίνη, ασπαραγινικό οξύ Asx B zcf asparagine (en), aspartic acid (en) ?02? (D, N)
ωβλ. γλουταμίνη, γλουταμινικό οξύ Glx Z zcf glutamine (en), glutamic acid (en) ?03? (E, Q)
ωβλ. λευκίνη, ισολευκίνη Xle J zcf leucine (en), isoleucine (en) ?04? (I, L)
ωγια υδρόφοβα z05  Φ zfor hydrophobic (en) ?05? (V, I, L, F, W, Y, M)
ωγια υδρόφιλα z06  ζ zfor hydrophilic (en) ?06? (S, T, H, N, Q, E, D, K, R)
ωγια αρωματικά z07  Ω zfor aromatic (en) ?07? (F, W, Y, H)
ωγια αλειφατικά z08  Ψ zfor aliphatic (en) (non‑aromatic) ?08? (V, I, L, M)
ωγια μικρά z09  π zfor small (en) ?09? (P, G, A, S)
ωγια θετικά φορτισμένα z10  + zfor positively (en) charged (en) ?10? (K, R, H)
ωγια αρνητικά φορτισμένα z11  - zfor negatively (en) charged (en) ?11? (D, E)